De Kladruber is het enige paardenras dat uitsluitend gefokt werd voor zijn gebruik tijdens plechtige ceremonies. Daarbij dienden de schimmels voor de wereldlijke, en de zwarten voor de kerkelijke ceremonies. De stamhengsten die hiervoor geselecteerd werden waren alle imposante, statige paarden.

Zij werden in 1552 door Keizer Maximiliaan II geïmporteerd uit Italië en Spanje. De officiële oprichting van de stoeterij door Keizer Rudolf II vond plaats op 14 april 1579. Hiermee behoort de stoeterij in Kladruby tot de oudste ter wereld.

De schimmels gaan terug op de Napolitaner hengst Imperatore door wie de hengstenlijnen Generale en Generalissimus ontstonden. De zwarten gaan terug op twee hengsten van Marquis Sacramoso. Deze lijn werd in de jaren 1930 gedecimeerd.

Om deze kleur terug te krijgen werd in het recente verleden gebruikgemaakt van de Friese hengst Romke. Daarnaast werd bloed toegevoerd van de Lipizzaner en de Shagya arabier om een kleiner en eleganter type te verkrijgen.

De Kladruber heeft een ramsneus (bol gebogen), grote bolle ogen, een hoge en krachtige halspartij, een vrij lange rug, stevige benen, stevige voetgewrichten en grote harde hoeven. De kleuren van dit ras zijn uitsluitend schimmel of zwart. De gangen zijn ruim. De draf toont fraaie actie.